喷码机在追溯体系中应用越来越广泛，农业部门对农产品质量的监管，主要在生产、收购、储存、运输环节进行。也就是说，管了两个‘大门口’——市场和加工场大门口农产品质量安全追溯是指能够追溯农产品在这4个环节中任何指定阶段质量状况的能力。简单来说，农产品追溯就是了解用什么种子，在什么地方种，喷的什么药，施的什么肥料等信息。通过一个完整的追溯体系，不但监管部门可以看到这些信息，消费者同样能够看到。
喷码机主要应用在生产这个环节上，如何给每个产品贴上唯一的标签呢？国家质量安全管理局给每个企业发送一串质量码，质量码的格式可以是txt.exl，等等。目前业内开发的软件能直接与喷码机通讯，将质量码数据导入软件中，传输到喷码机内，喷在每个产品上面，实现一物一码，一维码、二维码是当今主流应用。
追溯是市场的需求，因此，追溯信息应由从事农产品生产、收购、储存、运输的主体来提供。但要保证这些经营主体提供信息的真实可信，政府主管部门却不能“置身事外”。
